L’association GEFED est organisée en plusieurs instances, ainsi qu’il suit :

1. L’assemblée générale (AG) des membres qui est l’instance suprême et décisionnelle de l’association. Elle regroupe tous les membres actifs de l’association
2. Le conseil d’administration (CA) qui est l’instance d’orientation stratégique et d’administration de l’association. Il est composé d’un bureau comprenant un président, une secrétaire générale, un trésorier, et un collège de personnes ressources qui jouent le rôle de conseillers.
3. La coordination technique (CT) qui est une unité d’organisation, de suivi et d’évaluation des différents projets et programmes de l’association. Mise en place par le CA et rattachée à elle, la CT travaille en étroite collaboration avec le Bureau Exécutif, dont elle assure le suivi des indicateurs de performances.
4. Le Bureau Exécutif (BE) qui est l’organe d’exécution chargé au quotidien de la mise en œuvre des différentes activités de l’association. Il est composé d’une équipe de professionnels (salariés), de bénévoles et de volontaires, au nombre desquels des :

• chefs de programmes (à la tête de 03 directions)

• chargés de projets (à la tête de départements ou de services, et aidés par des assistants techniques et des animateurs )

• animateurs (en charge de sous projets, d’activités ou services)

• agents de bureau et du personnel de soutien

• techniciens et des ouvriers (spécialisés et non)